Kyousuke Kousaka 17 yaşında normal bir lise öğrencisidir. Hatırladığı kadarıyla, arasının her zaman kötü olduğu Kirino adında bir kız kardeşi vardır. Kız kardeşi Kirino, Kousaka'yı her zaman küçük görmekte ve onu reddetmektedir. Birgün Kousaka evde, üzerinde Hoshikuzu Witch Merle yazan bir DVD bulur. Kapağını açtığındaysa oldukça şaşırır çünkü içerisinde Imouto to Koishiyo! yani Kız Kardeşle Aşk Yap! adlı bir hentai video oyunu bulur. Bunun kime ait olduğunu bulmaya çalışan Kousaka, DVD'nin kız kardeşine ait olduğunu öğrendiğinde şok geçirir.İlk serinin devamıdır.